L'Institut Cancer et Immunologie (ICI) offre aux étudiants de Master et de Doctorat l'opportunité de suivre un programme de mobilité internationale mixte sur le thème "Innovations techniques en recherche fondamentale et translationnelle : Applications à l'immunologie-oncologie" au sein des universités de l'alliance CIVIS. Une mobilité virtuelle sous forme d'e-learning (webinars sur Moodle) et une mobilité physique de 5 jours dans des laboratoires et plateformes scientifiques de haute technologie, permettront aux étudiants de découvrir ou d'approfondir leurs compétences en Immuno-Oncologie.
Mobilité virtuelle ouverte du 01.03.2023 au 01.06.2023 (3 ECTS)
Mobilité physique à Aix-Marseille Université du 22.05.2023 au 26.05.2023 (3 ECTS)
Seconde édition du programme de mobilité mixte en immunologie-oncologie de l'Institut Cancer et Immunologie au sein de CIVIS, l'alliance des universités européennes civiques.
"Innovations techniques en recherche fondamentale et translationnelle en Immunologie-Oncologie"
6 ECTS (masters) - Heures de formation (doctorants)
Candidature du 1er au 30 novembre 2022 (lien ci-dessous)
https://civis.eu/en/civis-courses/technical-innovations-applications-to-immuno-oncology
Programme
L'objectif fondamental du programme proposé est de préparer les futurs scientifiques et médecins aux évolutions majeures des concepts actuels dans le domaine de l'immuno-oncologie en abordant les questions sous un angle technique. Ainsi, l'enseignement sera axé sur les applications techniques en immuno-oncologie fondamentale, translationnelle et clinique, à travers un cursus mixte de mobilité. La partie virtuelle se compose de 5 cours (cytométrie, organoïdes, génomiques, protéomiques et imagerie-microscopie). La partie physique se compose d'une mobilité d'une semaine dans des laboratoires et plateformes scientifiques de haute technologie à Aix-Marseille Université.
Les cours de la partie virtuelle contiennent des capsules numériques d'environ 60 minutes chacune comme suit. Les étudiants recevront les bases théoriques techniques leur permettant de comprendre le fonctionnement de ces technologies innovantes, ainsi que les applications à l'exploration de l'immunité anti-tumorale dans des aspects allant de la recherche fondamentale aux approches cliniques. L'étape critique de l'analyse des données à l'aide d'algorithmes d'apprentissage automatique sera également abordée dans les différents thèmes.
- Cytométrie (masse, flux et spectrale) :
- Cytométrie de flux multi-couleurs pour la caractérisation phénotypique des lymphocytes T infiltrant les tumeurs, Silvia Piconese, Sapienza Università di Roma
- Analyse cellulaire en temps réel dans le domaine de l'immuno-oncologie, Mihaela Economescu, Institut de Virologie Stefan S. Nicolau, Bucarest Roumanie
- Analyse multiparamétrique par cytométrie de flux pour la caractérisation phénotypique des changements associés à l'âge dans les sous-ensembles de cellules T circulantes, Maria Mittelbrunn, Universidad Autonoma de Madrid
- Evaluation des fonctions des neutrophiles dans le microenvironnement tumoral, Luminita Marutescu, Université de Bucarest
- Immunosurveillance du cancer - cellules NK et cancer, Gratiela Gradisteanu, Université de Bucarest
- Détection des points de contrôle immunitaires et de leurs ligands dans l'environnement tumoral par cytométrie en flux multicolore, Lilia Matei, Institut de virologie Stefan S. Nicolau, Bucarest (Roumanie)
- Evaluation de la fonction immunitaire dans les tumeurs à l'aide de la technologie multiplex xMAP, Coralia Bleotu, Stefan S. Nicolau Institute of Virology, Bucharest Romania
- Cytométrie en flux à imagerie multicolore pour la caractérisation de la réponse du cancer aux traitements médicamenteux, Cristina Elena Staicu, Institut national de physique des lasers, des plasmas et des rayonnements, Université de Bucarest ; Livia Elena Sima, Institut de biochimie de l'Académie roumaine
- Cytométrie de masse - Principes et applications, Amira A Ben Amara, Aix-Marseille Université
- Cytométrie de flux spectrale, Manon Richaud, Institut Paoli Calmettes, CRCM, Aix-Marseille Université
- Méthodes informatiques pour l'analyse des données de cytométrie en flux et en masse, Anne-Sophie Chretien, Aix-Marseille Université.
- Organoides :
- Les organoïdes : Nouveaux modèles biologiques pour la recherche en biologie du développement et en cancérologie, Géraldine Guasch, CRCM, Aix-Marseille Université
- Culture ex vivo d'organoïdes pour la médecine personnalisée et la médecine régénérative, Marie Isabelle Garcia, Université Libre de Bruxelles
- Modèles 3D in vitro du système nerveux humain : défis et opportunités, Alessandro Rosa, Sapienza Università di Roma
- Évaluation in vitro du métabolisme énergétique cellulaire et de la croissance cellulaire, Petronila Penela ; Angela Albitre ; Laura Formentini, Universidad Autónoma de Madrid
- Modèles animaux pour l'immunologie des tumeurs/modèles de souris pour la recherche en immunothérapie du cancer, Catalina Ribas ; Kostas Stamatakis ; María Sanz, Universidad Autónoma de Madrid.
- Génomique (CRSPR, RNAseq et TCRseq) :
- Génomique fonctionnelle à l'aide du criblage CRISPR, Sandrine Roulland, Aix-Marseille Université
- Microarrays d'ADN et RNAseq en transcriptomique dans le cancer, Rodolfo Negri, Sapienza Università di Roma
- ARN-seq à cellule unique (scRNAseq), Pierre Milpied, CIML, Aix-Marseille Université
- Séquençage TCR/CDR3 : aperçu du développement des cellules T et de leur réponse anticancéreuse, David Vermijlen, Center for Research in Immunology (U-CRI), Université Libre de Bruxelles
- Hands-on Introduction to RNA-Seq, Sumeet Pal Singh, IRIBHM, Université Libre de Bruxelles
- Protéomique :
- Analyse des protéines par spectrométrie de masse, Marco Crescenzi, Sapienza Università di Roma, Istituto Superiore di Sanità ; Serena Camerini, Istituto Superiore di Sanità
- Caractérisation de la glycosylation des IgG et son impact dans le cancer et l'immunologie, Cédric Delporte ; Yosra Helali, Université Libre de Bruxelles
- Réseaux de protéines en phase inverse : Identification de biomarqueurs protéiques de maladies, José M. Cuezva, Universidad Autónoma de Madrid
- Protéomique ciblée : Développement de la protéomique quantitative basée sur la surveillance des réactions parallèles (PRM) appliquée au cancer du sein her2-positif, Luc Camoin, Aix-Marseille Université
- Imagerie Maldi et anticorps thérapeutiques : application au gliome, Daniel Lafitte, Aix-Marseille Université
- Microscopie-Imagerie
- La cryo-microscopie électronique (Cryo-EM) pour l'étude des structures cellulaires fines et des complexes protéiques dans les cellules immunitaires et les cellules cancéreuses, Luciana Dini, Sapienza Università di Roma
- Microscopie à illumination structurée 3D pour l'étude de l'intégrité nucléaire et de l'invasion cancéreuse, Isabella Saggio, Sapienza Universita di Roma
- Organisation spatio-temporelle des complexes macromoléculaires impliqués dans la signalisation lymphocytaire, Didier Marguet, CIML, Aix-Marseille Université
- Techniques d'isolement et de caractérisation pour l'étude des exosomes, María Yáñez-Mó, Universidad Autónoma de Madrid ; Mar Valés-Gómez ; Noa Martín Cofreces
Les laboratoires d'accueil de la partie physique sont listés ci-dessous. Cette partie permettra aux étudiants de mettre en pratique ce qu'ils auront appris dans la partie virtuelle.
- Luc Camoin (Platform Proteomics, CRCM)
- Alice Carrier, (Laboratory Juan Iovanna, CRCM)
- Patrick Chames (laboratory of Patrick Chames, CRCM)
- Emmanuelle Charafe (Platform IPC/CRCM Experimental Pathology, CRCM)
- Anne-Sophie Chrétien (Laboratory of Daniel Olive, CRCM)
- Raynier Devillier (Laboratory of Daniel Olive, CRCM)
- Mathilde Poplineau (Laboratory d’Estelle Duprez, CRCM)
- Géraldine Guasch (Platform 3D-Hub-Organoids, CRCM)
- Paula Michea (Laboratory of Jean-Paul Borg, CRCM)
- Geoffrey Guittard (Laboratory of Jacques Nunes, CRCM)
- Erinn Soucie, (Laboratory of Juan Iovanna, CRCM)
- Richard Tomassini (Laboratory of Juan Iovanna, CRCM)
- Sophie Vasseur (Laboratory of Juan Iovanna, CRCM)
- Sandrine Henri (Laboratory of Bernard Malissen, CIML)
- Didier Marguet (Plateform ImagImm, CIML)
- Pierre Milpied (Laboratory of Pierre Milpied, CIML)
- Sandrine Roulland (Laboratory of Sandrine Roulland, CIML)
- Flavio Maina (Laboratory of Flavio Maina, IBDM)
Inscription
Clôture des inscription le 30.11.2022
Sélection des candidats, date butoir le 07.12.2022
Comité d'organisation
- Paula Michea, Aix-Marseille Université (AMU), Institut Cancer et Immunology (ICI), Faculté des Sciences de Marseille, Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM)
- Marie-dominique Franco, Project Manager, Institut Cancer et Immunology (ICI, AMU)
- Luminita Marutescu, Université de Bucarest, Faculté de biologie, Département de biotechnologie et de ressources renouvelables, Plate-forme de recherche en biologie et écologie des systèmes.
- Catalina Ribas and María Yánez Mo, Université autonome de Madrid, Faculté des sciences, Département de biologie moléculaire.
- Loretta Tuosto, Sapienza Università di Roma, Faculté des sciences mathématiques, physiques et naturelles, Département de biologie et biotechnologie Charles Darwin (BBCD)
- David Vermijlen, ULB Center for Research in Immunology (U-CRI), Faculté de pharmacie, Département de pharmacothérapie et de pharmacie et Centre de recherche en immunologie