La Mission Interdisciplinarité s’appuie sur un Observatoire des Pratiques Interdisciplinaires et Interculturelles. Financé dans le cadre du projet IDeAL, cet Observatoire vise à documenter les pratiques interdisciplinaires et interculturelles pour mieux les structurer en communautés de pratiques. S’agissant d’interculturalité, il bénéficie de l’expérience à l’international des organismes de recherche partenaires, notamment celles du CNRS et de l’IRD, et des collaborations d’AMU avec ses partenaires internationaux parmi lesquels l’Alliance CIVIS. L'Observatoire alimente la Mission au travers d’une approche méthodologique mixte et multidimensionnelle combinant données qualitatives et quantitatives, afin d’appréhender les pratiques interdisciplinaires et interculturelles dans leur diversité. Ainsi, l’Observatoire des pratiques interdisciplinaires et interculturelles :
• Propose et collecte des indicateurs pour évaluer les projets spécifiques et pour mesurer la progression de l’intégration interdisciplinaire et interculturelle au sein de l’établissement ;
• Coproduit avec les acteurs des cadres de référence, des questionnaires et autres outils méthodologiques destinés à les aider à mieux prendre en compte l’interdisciplinarité dans leurs projets ; l'Observatoire a notamment élaboré une grille d'autoévaluation et d'aide à la conception des projets de recherche interdisciplinaire ;
• Capitalise un ensemble de données destinées à observer la trajectoire interdisciplinaire de l’établissement et à mesurer l’impact de la Mission Interdisciplinarité, l’impact étant défini comme « la situation issue de l’ensemble des changements significatifs et durables, positifs ou négatifs, prévus ou imprévus, pour lesquels un lien de causalité direct ou indirect peut être établi avec l’action » ;
• Rédige des monographies et des études de cas sur les actions phares soutenues par la Mission, afin de contribuer aux rapports annuels de cette dernière.